Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ufsp2Q99K23 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ufsp2Q99K23 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms