Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim59Q922Y2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim59Q922Y2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim59Q922Y2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim59Q922Y2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim59Q922Y2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim59Q922Y2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim59Q922Y2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim59Q922Y2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim59Q922Y2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim59Q922Y2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim59Q922Y2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim59Q922Y2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim59Q922Y2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim59Q922Y2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trim59Q922Y2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Trim59Q922Y2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim59Q922Y2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim59Q922Y2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim59Q922Y2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim59Q922Y2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim59Q922Y2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim59Q922Y2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim59Q922Y2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim59Q922Y2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim59Q922Y2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim59Q922Y2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim59Q922Y2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim59Q922Y2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim59Q922Y2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim59Q922Y2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim59Q922Y2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim59Q922Y2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim59Q922Y2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim59Q922Y2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim59Q922Y2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim59Q922Y2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim59Q922Y2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim59Q922Y2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim59Q922Y2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim59Q922Y2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim59Q922Y2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim59Q922Y2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim59Q922Y2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim59Q922Y2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim59Q922Y2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim59Q922Y2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim59Q922Y2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim59Q922Y2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim59Q922Y2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim59Q922Y2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim59Q922Y2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim59Q922Y2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim59Q922Y2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim59Q922Y2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim59Q922Y2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim59Q922Y2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim59Q922Y2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim59Q922Y2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim59Q922Y2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim59Q922Y2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim59Q922Y2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim59Q922Y2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim59Q922Y2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim59Q922Y2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim59Q922Y2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim59Q922Y2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim59Q922Y2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim59Q922Y2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim59Q922Y2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim59Q922Y2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim59Q922Y2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim59Q922Y2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim59Q922Y2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim59Q922Y2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim59Q922Y2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim59Q922Y2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim59Q922Y2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim59Q922Y2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim59Q922Y2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim59Q922Y2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim59Q922Y2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim59Q922Y2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim59Q922Y2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim59Q922Y2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim59Q922Y2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim59Q922Y2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim59Q922Y2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim59Q922Y2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim59Q922Y2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms