Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf3Q920N1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms