Protein–RNA interactions for Protein: Q920E5

Fdps, Farnesyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FdpsQ920E5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FdpsQ920E5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FdpsQ920E5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FdpsQ920E5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FdpsQ920E5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FdpsQ920E5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FdpsQ920E5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FdpsQ920E5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FdpsQ920E5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FdpsQ920E5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FdpsQ920E5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FdpsQ920E5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FdpsQ920E5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FdpsQ920E5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FdpsQ920E5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FdpsQ920E5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FdpsQ920E5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FdpsQ920E5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FdpsQ920E5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FdpsQ920E5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms