Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW9

Zkscan3, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan3Q91VW9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zkscan3Q91VW9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zkscan3Q91VW9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zkscan3Q91VW9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Zkscan3Q91VW9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zkscan3Q91VW9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zkscan3Q91VW9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Zkscan3Q91VW9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zkscan3Q91VW9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zkscan3Q91VW9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zkscan3Q91VW9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zkscan3Q91VW9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zkscan3Q91VW9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zkscan3Q91VW9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zkscan3Q91VW9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zkscan3Q91VW9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zkscan3Q91VW9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zkscan3Q91VW9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zkscan3Q91VW9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zkscan3Q91VW9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zkscan3Q91VW9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zkscan3Q91VW9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zkscan3Q91VW9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zkscan3Q91VW9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zkscan3Q91VW9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zkscan3Q91VW9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zkscan3Q91VW9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zkscan3Q91VW9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zkscan3Q91VW9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zkscan3Q91VW9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zkscan3Q91VW9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zkscan3Q91VW9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zkscan3Q91VW9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zkscan3Q91VW9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Zkscan3Q91VW9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zkscan3Q91VW9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zkscan3Q91VW9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zkscan3Q91VW9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zkscan3Q91VW9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zkscan3Q91VW9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zkscan3Q91VW9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zkscan3Q91VW9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zkscan3Q91VW9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zkscan3Q91VW9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zkscan3Q91VW9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zkscan3Q91VW9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zkscan3Q91VW9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zkscan3Q91VW9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zkscan3Q91VW9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zkscan3Q91VW9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zkscan3Q91VW9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zkscan3Q91VW9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Zkscan3Q91VW9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zkscan3Q91VW9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zkscan3Q91VW9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zkscan3Q91VW9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zkscan3Q91VW9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zkscan3Q91VW9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zkscan3Q91VW9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zkscan3Q91VW9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zkscan3Q91VW9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zkscan3Q91VW9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zkscan3Q91VW9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zkscan3Q91VW9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zkscan3Q91VW9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zkscan3Q91VW9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zkscan3Q91VW9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zkscan3Q91VW9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Zkscan3Q91VW9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zkscan3Q91VW9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zkscan3Q91VW9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Zkscan3Q91VW9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zkscan3Q91VW9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Zkscan3Q91VW9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zkscan3Q91VW9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zkscan3Q91VW9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zkscan3Q91VW9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zkscan3Q91VW9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zkscan3Q91VW9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zkscan3Q91VW9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zkscan3Q91VW9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zkscan3Q91VW9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zkscan3Q91VW9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zkscan3Q91VW9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zkscan3Q91VW9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zkscan3Q91VW9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zkscan3Q91VW9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zkscan3Q91VW9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zkscan3Q91VW9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zkscan3Q91VW9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zkscan3Q91VW9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zkscan3Q91VW9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zkscan3Q91VW9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zkscan3Q91VW9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Zkscan3Q91VW9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zkscan3Q91VW9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zkscan3Q91VW9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms