Protein–RNA interactions for Protein: Q91VK4

Itm2c, Integral membrane protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2cQ91VK4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itm2cQ91VK4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itm2cQ91VK4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Itm2cQ91VK4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itm2cQ91VK4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itm2cQ91VK4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itm2cQ91VK4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itm2cQ91VK4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itm2cQ91VK4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Itm2cQ91VK4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Itm2cQ91VK4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itm2cQ91VK4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itm2cQ91VK4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itm2cQ91VK4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itm2cQ91VK4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itm2cQ91VK4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itm2cQ91VK4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itm2cQ91VK4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itm2cQ91VK4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itm2cQ91VK4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Itm2cQ91VK4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itm2cQ91VK4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itm2cQ91VK4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itm2cQ91VK4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itm2cQ91VK4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itm2cQ91VK4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Itm2cQ91VK4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itm2cQ91VK4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itm2cQ91VK4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Itm2cQ91VK4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itm2cQ91VK4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itm2cQ91VK4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itm2cQ91VK4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itm2cQ91VK4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itm2cQ91VK4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itm2cQ91VK4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itm2cQ91VK4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itm2cQ91VK4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itm2cQ91VK4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itm2cQ91VK4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itm2cQ91VK4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Itm2cQ91VK4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Itm2cQ91VK4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Itm2cQ91VK4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Itm2cQ91VK4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itm2cQ91VK4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itm2cQ91VK4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itm2cQ91VK4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itm2cQ91VK4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itm2cQ91VK4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itm2cQ91VK4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itm2cQ91VK4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itm2cQ91VK4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itm2cQ91VK4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itm2cQ91VK4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itm2cQ91VK4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itm2cQ91VK4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itm2cQ91VK4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itm2cQ91VK4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itm2cQ91VK4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itm2cQ91VK4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itm2cQ91VK4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Itm2cQ91VK4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itm2cQ91VK4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itm2cQ91VK4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itm2cQ91VK4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itm2cQ91VK4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itm2cQ91VK4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itm2cQ91VK4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itm2cQ91VK4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itm2cQ91VK4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itm2cQ91VK4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itm2cQ91VK4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itm2cQ91VK4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itm2cQ91VK4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itm2cQ91VK4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itm2cQ91VK4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Itm2cQ91VK4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itm2cQ91VK4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itm2cQ91VK4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Itm2cQ91VK4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Itm2cQ91VK4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itm2cQ91VK4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itm2cQ91VK4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itm2cQ91VK4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itm2cQ91VK4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itm2cQ91VK4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itm2cQ91VK4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Itm2cQ91VK4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itm2cQ91VK4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itm2cQ91VK4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itm2cQ91VK4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Itm2cQ91VK4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itm2cQ91VK4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itm2cQ91VK4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itm2cQ91VK4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itm2cQ91VK4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itm2cQ91VK4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itm2cQ91VK4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itm2cQ91VK4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms