Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SnrkQ8VDU5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SnrkQ8VDU5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SnrkQ8VDU5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SnrkQ8VDU5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SnrkQ8VDU5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SnrkQ8VDU5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SnrkQ8VDU5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SnrkQ8VDU5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SnrkQ8VDU5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SnrkQ8VDU5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SnrkQ8VDU5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SnrkQ8VDU5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SnrkQ8VDU5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SnrkQ8VDU5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SnrkQ8VDU5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SnrkQ8VDU5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SnrkQ8VDU5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SnrkQ8VDU5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SnrkQ8VDU5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SnrkQ8VDU5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SnrkQ8VDU5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SnrkQ8VDU5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SnrkQ8VDU5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SnrkQ8VDU5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SnrkQ8VDU5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SnrkQ8VDU5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SnrkQ8VDU5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SnrkQ8VDU5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SnrkQ8VDU5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SnrkQ8VDU5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SnrkQ8VDU5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SnrkQ8VDU5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SnrkQ8VDU5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SnrkQ8VDU5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SnrkQ8VDU5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SnrkQ8VDU5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SnrkQ8VDU5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SnrkQ8VDU5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SnrkQ8VDU5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SnrkQ8VDU5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SnrkQ8VDU5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SnrkQ8VDU5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SnrkQ8VDU5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SnrkQ8VDU5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SnrkQ8VDU5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SnrkQ8VDU5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SnrkQ8VDU5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SnrkQ8VDU5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SnrkQ8VDU5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SnrkQ8VDU5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SnrkQ8VDU5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SnrkQ8VDU5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SnrkQ8VDU5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SnrkQ8VDU5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SnrkQ8VDU5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SnrkQ8VDU5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SnrkQ8VDU5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SnrkQ8VDU5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SnrkQ8VDU5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SnrkQ8VDU5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SnrkQ8VDU5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SnrkQ8VDU5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SnrkQ8VDU5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SnrkQ8VDU5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SnrkQ8VDU5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SnrkQ8VDU5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SnrkQ8VDU5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SnrkQ8VDU5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SnrkQ8VDU5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SnrkQ8VDU5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SnrkQ8VDU5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SnrkQ8VDU5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SnrkQ8VDU5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SnrkQ8VDU5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SnrkQ8VDU5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SnrkQ8VDU5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SnrkQ8VDU5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SnrkQ8VDU5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SnrkQ8VDU5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SnrkQ8VDU5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SnrkQ8VDU5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SnrkQ8VDU5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SnrkQ8VDU5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SnrkQ8VDU5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SnrkQ8VDU5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SnrkQ8VDU5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SnrkQ8VDU5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SnrkQ8VDU5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SnrkQ8VDU5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SnrkQ8VDU5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SnrkQ8VDU5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SnrkQ8VDU5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SnrkQ8VDU5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SnrkQ8VDU5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SnrkQ8VDU5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SnrkQ8VDU5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SnrkQ8VDU5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SnrkQ8VDU5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SnrkQ8VDU5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms