Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rprd1aQ8VDS4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rprd1aQ8VDS4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rprd1aQ8VDS4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rprd1aQ8VDS4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rprd1aQ8VDS4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rprd1aQ8VDS4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rprd1aQ8VDS4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rprd1aQ8VDS4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rprd1aQ8VDS4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rprd1aQ8VDS4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rprd1aQ8VDS4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rprd1aQ8VDS4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rprd1aQ8VDS4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rprd1aQ8VDS4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms