Protein–RNA interactions for Protein: Q8R480

Nup85, Nuclear pore complex protein Nup85, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup85Q8R480 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup85Q8R480 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup85Q8R480 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup85Q8R480 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup85Q8R480 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup85Q8R480 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup85Q8R480 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup85Q8R480 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup85Q8R480 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup85Q8R480 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup85Q8R480 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup85Q8R480 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup85Q8R480 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup85Q8R480 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup85Q8R480 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup85Q8R480 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup85Q8R480 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup85Q8R480 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup85Q8R480 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup85Q8R480 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup85Q8R480 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup85Q8R480 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nup85Q8R480 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nup85Q8R480 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup85Q8R480 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup85Q8R480 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup85Q8R480 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup85Q8R480 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup85Q8R480 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup85Q8R480 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup85Q8R480 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup85Q8R480 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup85Q8R480 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nup85Q8R480 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Nup85Q8R480 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nup85Q8R480 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nup85Q8R480 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nup85Q8R480 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup85Q8R480 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup85Q8R480 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup85Q8R480 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup85Q8R480 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup85Q8R480 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup85Q8R480 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup85Q8R480 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup85Q8R480 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup85Q8R480 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup85Q8R480 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup85Q8R480 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup85Q8R480 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup85Q8R480 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup85Q8R480 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup85Q8R480 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup85Q8R480 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup85Q8R480 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup85Q8R480 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup85Q8R480 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup85Q8R480 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup85Q8R480 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup85Q8R480 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms