Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2T8

Gtf3c5, General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5Q8R2T8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtf3c5Q8R2T8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtf3c5Q8R2T8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtf3c5Q8R2T8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtf3c5Q8R2T8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtf3c5Q8R2T8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtf3c5Q8R2T8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf3c5Q8R2T8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gtf3c5Q8R2T8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gtf3c5Q8R2T8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf3c5Q8R2T8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf3c5Q8R2T8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf3c5Q8R2T8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf3c5Q8R2T8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf3c5Q8R2T8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf3c5Q8R2T8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf3c5Q8R2T8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf3c5Q8R2T8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf3c5Q8R2T8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf3c5Q8R2T8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf3c5Q8R2T8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf3c5Q8R2T8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf3c5Q8R2T8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf3c5Q8R2T8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf3c5Q8R2T8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf3c5Q8R2T8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf3c5Q8R2T8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf3c5Q8R2T8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf3c5Q8R2T8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf3c5Q8R2T8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf3c5Q8R2T8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf3c5Q8R2T8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf3c5Q8R2T8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf3c5Q8R2T8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf3c5Q8R2T8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf3c5Q8R2T8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf3c5Q8R2T8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtf3c5Q8R2T8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtf3c5Q8R2T8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtf3c5Q8R2T8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtf3c5Q8R2T8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf3c5Q8R2T8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf3c5Q8R2T8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf3c5Q8R2T8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf3c5Q8R2T8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf3c5Q8R2T8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf3c5Q8R2T8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf3c5Q8R2T8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.4 ms