Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim29Q8R2Q0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms