Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ncapd2Q8K2Z4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ncapd2Q8K2Z4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ncapd2Q8K2Z4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ncapd2Q8K2Z4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ncapd2Q8K2Z4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ncapd2Q8K2Z4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ncapd2Q8K2Z4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ncapd2Q8K2Z4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ncapd2Q8K2Z4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ncapd2Q8K2Z4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ncapd2Q8K2Z4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ncapd2Q8K2Z4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ncapd2Q8K2Z4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ncapd2Q8K2Z4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ncapd2Q8K2Z4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ncapd2Q8K2Z4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ncapd2Q8K2Z4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ncapd2Q8K2Z4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ncapd2Q8K2Z4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ncapd2Q8K2Z4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ncapd2Q8K2Z4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ncapd2Q8K2Z4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ncapd2Q8K2Z4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ncapd2Q8K2Z4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ncapd2Q8K2Z4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ncapd2Q8K2Z4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ncapd2Q8K2Z4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ncapd2Q8K2Z4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ncapd2Q8K2Z4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ncapd2Q8K2Z4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ncapd2Q8K2Z4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ncapd2Q8K2Z4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ncapd2Q8K2Z4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ncapd2Q8K2Z4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ncapd2Q8K2Z4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ncapd2Q8K2Z4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ncapd2Q8K2Z4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ncapd2Q8K2Z4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ncapd2Q8K2Z4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Ncapd2Q8K2Z4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ncapd2Q8K2Z4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ncapd2Q8K2Z4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ncapd2Q8K2Z4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ncapd2Q8K2Z4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Ncapd2Q8K2Z4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ncapd2Q8K2Z4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ncapd2Q8K2Z4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Ncapd2Q8K2Z4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ncapd2Q8K2Z4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ncapd2Q8K2Z4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ncapd2Q8K2Z4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Ncapd2Q8K2Z4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ncapd2Q8K2Z4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Ncapd2Q8K2Z4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ncapd2Q8K2Z4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ncapd2Q8K2Z4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ncapd2Q8K2Z4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ncapd2Q8K2Z4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ncapd2Q8K2Z4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ncapd2Q8K2Z4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ncapd2Q8K2Z4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Ncapd2Q8K2Z4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ncapd2Q8K2Z4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ncapd2Q8K2Z4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ncapd2Q8K2Z4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ncapd2Q8K2Z4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Ncapd2Q8K2Z4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Ncapd2Q8K2Z4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Ncapd2Q8K2Z4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ncapd2Q8K2Z4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ncapd2Q8K2Z4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ncapd2Q8K2Z4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ncapd2Q8K2Z4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ncapd2Q8K2Z4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ncapd2Q8K2Z4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Ncapd2Q8K2Z4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ncapd2Q8K2Z4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ncapd2Q8K2Z4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ncapd2Q8K2Z4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ncapd2Q8K2Z4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ncapd2Q8K2Z4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ncapd2Q8K2Z4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ncapd2Q8K2Z4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ncapd2Q8K2Z4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ncapd2Q8K2Z4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms