Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Paf1Q8K2T8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Paf1Q8K2T8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Paf1Q8K2T8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Paf1Q8K2T8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Paf1Q8K2T8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Paf1Q8K2T8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Paf1Q8K2T8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Paf1Q8K2T8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Paf1Q8K2T8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Paf1Q8K2T8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Paf1Q8K2T8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Paf1Q8K2T8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Paf1Q8K2T8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Paf1Q8K2T8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms