Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hacd3Q8K2C9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hacd3Q8K2C9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hacd3Q8K2C9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms