Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Brf1Q8CFK2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Brf1Q8CFK2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Brf1Q8CFK2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Brf1Q8CFK2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Brf1Q8CFK2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Brf1Q8CFK2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Brf1Q8CFK2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brf1Q8CFK2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brf1Q8CFK2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brf1Q8CFK2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brf1Q8CFK2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brf1Q8CFK2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Brf1Q8CFK2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Brf1Q8CFK2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Brf1Q8CFK2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Brf1Q8CFK2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Brf1Q8CFK2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Brf1Q8CFK2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Brf1Q8CFK2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Brf1Q8CFK2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Brf1Q8CFK2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Brf1Q8CFK2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Brf1Q8CFK2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Brf1Q8CFK2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Brf1Q8CFK2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Brf1Q8CFK2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Brf1Q8CFK2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Brf1Q8CFK2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Brf1Q8CFK2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Brf1Q8CFK2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Brf1Q8CFK2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Brf1Q8CFK2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Brf1Q8CFK2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Brf1Q8CFK2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Brf1Q8CFK2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Brf1Q8CFK2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Brf1Q8CFK2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Brf1Q8CFK2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Brf1Q8CFK2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Brf1Q8CFK2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Brf1Q8CFK2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Brf1Q8CFK2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Brf1Q8CFK2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Brf1Q8CFK2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Brf1Q8CFK2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Brf1Q8CFK2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Brf1Q8CFK2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Brf1Q8CFK2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Brf1Q8CFK2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Brf1Q8CFK2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Brf1Q8CFK2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Brf1Q8CFK2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Brf1Q8CFK2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Brf1Q8CFK2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Brf1Q8CFK2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Brf1Q8CFK2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Brf1Q8CFK2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
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