Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nup88Q8CEC0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nup88Q8CEC0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nup88Q8CEC0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nup88Q8CEC0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nup88Q8CEC0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nup88Q8CEC0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nup88Q8CEC0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nup88Q8CEC0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nup88Q8CEC0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nup88Q8CEC0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nup88Q8CEC0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nup88Q8CEC0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nup88Q8CEC0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nup88Q8CEC0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Nup88Q8CEC0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nup88Q8CEC0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nup88Q8CEC0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nup88Q8CEC0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nup88Q8CEC0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup88Q8CEC0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup88Q8CEC0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup88Q8CEC0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup88Q8CEC0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup88Q8CEC0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup88Q8CEC0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup88Q8CEC0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup88Q8CEC0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup88Q8CEC0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup88Q8CEC0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup88Q8CEC0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup88Q8CEC0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup88Q8CEC0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup88Q8CEC0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup88Q8CEC0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup88Q8CEC0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup88Q8CEC0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup88Q8CEC0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup88Q8CEC0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup88Q8CEC0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup88Q8CEC0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup88Q8CEC0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup88Q8CEC0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup88Q8CEC0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup88Q8CEC0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup88Q8CEC0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup88Q8CEC0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup88Q8CEC0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup88Q8CEC0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup88Q8CEC0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup88Q8CEC0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup88Q8CEC0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup88Q8CEC0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup88Q8CEC0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup88Q8CEC0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup88Q8CEC0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup88Q8CEC0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup88Q8CEC0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms