Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD15

Riox2, Ribosomal oxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox2Q8CD15 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Riox2Q8CD15 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Riox2Q8CD15 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Riox2Q8CD15 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Riox2Q8CD15 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Riox2Q8CD15 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Riox2Q8CD15 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Riox2Q8CD15 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Riox2Q8CD15 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Riox2Q8CD15 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Riox2Q8CD15 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Riox2Q8CD15 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Riox2Q8CD15 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Riox2Q8CD15 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Riox2Q8CD15 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Riox2Q8CD15 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Riox2Q8CD15 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Riox2Q8CD15 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Riox2Q8CD15 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Riox2Q8CD15 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Riox2Q8CD15 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Riox2Q8CD15 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Riox2Q8CD15 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Riox2Q8CD15 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Riox2Q8CD15 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Riox2Q8CD15 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Riox2Q8CD15 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Riox2Q8CD15 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Riox2Q8CD15 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Riox2Q8CD15 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Riox2Q8CD15 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Riox2Q8CD15 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Riox2Q8CD15 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Riox2Q8CD15 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Riox2Q8CD15 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Riox2Q8CD15 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Riox2Q8CD15 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Riox2Q8CD15 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Riox2Q8CD15 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Riox2Q8CD15 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Riox2Q8CD15 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Riox2Q8CD15 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Riox2Q8CD15 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Riox2Q8CD15 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Riox2Q8CD15 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Riox2Q8CD15 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Riox2Q8CD15 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Riox2Q8CD15 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Riox2Q8CD15 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Riox2Q8CD15 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Riox2Q8CD15 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Riox2Q8CD15 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Riox2Q8CD15 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Riox2Q8CD15 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Riox2Q8CD15 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Riox2Q8CD15 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Riox2Q8CD15 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Riox2Q8CD15 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Riox2Q8CD15 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Riox2Q8CD15 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Riox2Q8CD15 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Riox2Q8CD15 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Riox2Q8CD15 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Riox2Q8CD15 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Riox2Q8CD15 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Riox2Q8CD15 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Riox2Q8CD15 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Riox2Q8CD15 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Riox2Q8CD15 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms