Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5W0

Clmn, Calmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmnQ8C5W0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ClmnQ8C5W0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ClmnQ8C5W0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ClmnQ8C5W0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ClmnQ8C5W0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ClmnQ8C5W0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ClmnQ8C5W0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ClmnQ8C5W0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ClmnQ8C5W0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ClmnQ8C5W0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ClmnQ8C5W0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ClmnQ8C5W0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ClmnQ8C5W0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ClmnQ8C5W0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ClmnQ8C5W0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ClmnQ8C5W0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ClmnQ8C5W0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ClmnQ8C5W0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ClmnQ8C5W0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ClmnQ8C5W0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ClmnQ8C5W0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ClmnQ8C5W0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ClmnQ8C5W0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ClmnQ8C5W0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ClmnQ8C5W0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClmnQ8C5W0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClmnQ8C5W0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClmnQ8C5W0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClmnQ8C5W0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClmnQ8C5W0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClmnQ8C5W0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClmnQ8C5W0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClmnQ8C5W0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClmnQ8C5W0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClmnQ8C5W0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClmnQ8C5W0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClmnQ8C5W0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClmnQ8C5W0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ClmnQ8C5W0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClmnQ8C5W0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClmnQ8C5W0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClmnQ8C5W0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ClmnQ8C5W0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClmnQ8C5W0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClmnQ8C5W0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClmnQ8C5W0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ClmnQ8C5W0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ClmnQ8C5W0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ClmnQ8C5W0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ClmnQ8C5W0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ClmnQ8C5W0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ClmnQ8C5W0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ClmnQ8C5W0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ClmnQ8C5W0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ClmnQ8C5W0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ClmnQ8C5W0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ClmnQ8C5W0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ClmnQ8C5W0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ClmnQ8C5W0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms