Protein–RNA interactions for Protein: Q8C263

Ska3, Spindle and kinetochore-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska3Q8C263 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ska3Q8C263 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ska3Q8C263 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ska3Q8C263 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ska3Q8C263 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ska3Q8C263 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ska3Q8C263 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ska3Q8C263 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ska3Q8C263 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ska3Q8C263 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ska3Q8C263 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ska3Q8C263 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ska3Q8C263 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ska3Q8C263 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ska3Q8C263 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ska3Q8C263 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ska3Q8C263 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ska3Q8C263 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ska3Q8C263 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ska3Q8C263 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ska3Q8C263 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ska3Q8C263 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ska3Q8C263 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ska3Q8C263 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ska3Q8C263 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ska3Q8C263 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ska3Q8C263 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ska3Q8C263 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ska3Q8C263 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ska3Q8C263 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ska3Q8C263 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ska3Q8C263 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ska3Q8C263 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ska3Q8C263 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ska3Q8C263 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ska3Q8C263 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ska3Q8C263 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ska3Q8C263 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ska3Q8C263 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ska3Q8C263 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ska3Q8C263 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ska3Q8C263 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ska3Q8C263 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ska3Q8C263 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ska3Q8C263 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ska3Q8C263 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ska3Q8C263 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ska3Q8C263 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ska3Q8C263 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ska3Q8C263 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ska3Q8C263 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ska3Q8C263 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ska3Q8C263 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ska3Q8C263 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ska3Q8C263 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ska3Q8C263 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ska3Q8C263 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ska3Q8C263 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ska3Q8C263 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ska3Q8C263 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ska3Q8C263 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ska3Q8C263 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ska3Q8C263 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ska3Q8C263 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ska3Q8C263 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ska3Q8C263 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ska3Q8C263 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ska3Q8C263 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ska3Q8C263 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ska3Q8C263 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ska3Q8C263 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ska3Q8C263 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ska3Q8C263 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ska3Q8C263 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ska3Q8C263 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ska3Q8C263 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ska3Q8C263 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ska3Q8C263 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ska3Q8C263 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ska3Q8C263 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ska3Q8C263 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ska3Q8C263 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ska3Q8C263 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ska3Q8C263 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ska3Q8C263 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ska3Q8C263 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ska3Q8C263 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ska3Q8C263 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ska3Q8C263 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ska3Q8C263 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ska3Q8C263 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ska3Q8C263 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ska3Q8C263 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ska3Q8C263 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ska3Q8C263 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ska3Q8C263 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ska3Q8C263 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ska3Q8C263 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ska3Q8C263 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ska3Q8C263 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms