Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1F4

Csgalnact2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csgalnact2Q8C1F4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Csgalnact2Q8C1F4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Csgalnact2Q8C1F4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Csgalnact2Q8C1F4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Csgalnact2Q8C1F4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Csgalnact2Q8C1F4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Csgalnact2Q8C1F4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Csgalnact2Q8C1F4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Csgalnact2Q8C1F4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Csgalnact2Q8C1F4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Csgalnact2Q8C1F4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Csgalnact2Q8C1F4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Csgalnact2Q8C1F4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Csgalnact2Q8C1F4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Csgalnact2Q8C1F4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Csgalnact2Q8C1F4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Csgalnact2Q8C1F4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Csgalnact2Q8C1F4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Csgalnact2Q8C1F4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Csgalnact2Q8C1F4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Csgalnact2Q8C1F4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Csgalnact2Q8C1F4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Csgalnact2Q8C1F4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Csgalnact2Q8C1F4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Csgalnact2Q8C1F4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Csgalnact2Q8C1F4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Csgalnact2Q8C1F4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Csgalnact2Q8C1F4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Csgalnact2Q8C1F4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Csgalnact2Q8C1F4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Csgalnact2Q8C1F4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Csgalnact2Q8C1F4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Csgalnact2Q8C1F4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Csgalnact2Q8C1F4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Csgalnact2Q8C1F4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Csgalnact2Q8C1F4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Csgalnact2Q8C1F4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Csgalnact2Q8C1F4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Csgalnact2Q8C1F4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Csgalnact2Q8C1F4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Csgalnact2Q8C1F4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Csgalnact2Q8C1F4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Csgalnact2Q8C1F4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Csgalnact2Q8C1F4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Csgalnact2Q8C1F4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Csgalnact2Q8C1F4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Csgalnact2Q8C1F4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Csgalnact2Q8C1F4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Csgalnact2Q8C1F4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Csgalnact2Q8C1F4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Csgalnact2Q8C1F4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms