Protein–RNA interactions for Protein: Q8C165

Pm20d1, N-fatty-acyl-amino acid synthase/hydrolase PM20D1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d1Q8C165 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pm20d1Q8C165 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Pm20d1Q8C165 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pm20d1Q8C165 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pm20d1Q8C165 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pm20d1Q8C165 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Pm20d1Q8C165 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pm20d1Q8C165 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pm20d1Q8C165 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pm20d1Q8C165 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pm20d1Q8C165 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pm20d1Q8C165 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Pm20d1Q8C165 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pm20d1Q8C165 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pm20d1Q8C165 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Pm20d1Q8C165 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Pm20d1Q8C165 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pm20d1Q8C165 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pm20d1Q8C165 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pm20d1Q8C165 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pm20d1Q8C165 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pm20d1Q8C165 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pm20d1Q8C165 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pm20d1Q8C165 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Pm20d1Q8C165 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Pm20d1Q8C165 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pm20d1Q8C165 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Pm20d1Q8C165 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pm20d1Q8C165 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pm20d1Q8C165 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pm20d1Q8C165 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pm20d1Q8C165 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pm20d1Q8C165 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pm20d1Q8C165 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pm20d1Q8C165 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pm20d1Q8C165 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pm20d1Q8C165 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pm20d1Q8C165 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pm20d1Q8C165 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pm20d1Q8C165 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pm20d1Q8C165 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pm20d1Q8C165 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pm20d1Q8C165 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pm20d1Q8C165 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pm20d1Q8C165 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pm20d1Q8C165 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pm20d1Q8C165 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pm20d1Q8C165 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pm20d1Q8C165 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pm20d1Q8C165 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pm20d1Q8C165 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pm20d1Q8C165 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pm20d1Q8C165 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pm20d1Q8C165 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pm20d1Q8C165 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pm20d1Q8C165 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pm20d1Q8C165 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pm20d1Q8C165 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pm20d1Q8C165 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pm20d1Q8C165 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pm20d1Q8C165 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pm20d1Q8C165 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pm20d1Q8C165 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pm20d1Q8C165 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pm20d1Q8C165 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pm20d1Q8C165 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Pm20d1Q8C165 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pm20d1Q8C165 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pm20d1Q8C165 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pm20d1Q8C165 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pm20d1Q8C165 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pm20d1Q8C165 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pm20d1Q8C165 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pm20d1Q8C165 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pm20d1Q8C165 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pm20d1Q8C165 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pm20d1Q8C165 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pm20d1Q8C165 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pm20d1Q8C165 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pm20d1Q8C165 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pm20d1Q8C165 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pm20d1Q8C165 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pm20d1Q8C165 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pm20d1Q8C165 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pm20d1Q8C165 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pm20d1Q8C165 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pm20d1Q8C165 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pm20d1Q8C165 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pm20d1Q8C165 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pm20d1Q8C165 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pm20d1Q8C165 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pm20d1Q8C165 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pm20d1Q8C165 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pm20d1Q8C165 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pm20d1Q8C165 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pm20d1Q8C165 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pm20d1Q8C165 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pm20d1Q8C165 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pm20d1Q8C165 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pm20d1Q8C165 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms