Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Iffo1Q8BXL9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Iffo1Q8BXL9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Iffo1Q8BXL9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Iffo1Q8BXL9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Iffo1Q8BXL9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Iffo1Q8BXL9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Iffo1Q8BXL9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Iffo1Q8BXL9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Iffo1Q8BXL9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Iffo1Q8BXL9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Iffo1Q8BXL9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Iffo1Q8BXL9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Iffo1Q8BXL9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Iffo1Q8BXL9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Iffo1Q8BXL9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Iffo1Q8BXL9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Iffo1Q8BXL9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Iffo1Q8BXL9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Iffo1Q8BXL9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Iffo1Q8BXL9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Iffo1Q8BXL9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Iffo1Q8BXL9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Iffo1Q8BXL9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Iffo1Q8BXL9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Iffo1Q8BXL9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Iffo1Q8BXL9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Iffo1Q8BXL9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Iffo1Q8BXL9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Iffo1Q8BXL9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Iffo1Q8BXL9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Iffo1Q8BXL9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Iffo1Q8BXL9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Iffo1Q8BXL9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Iffo1Q8BXL9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Iffo1Q8BXL9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Iffo1Q8BXL9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Iffo1Q8BXL9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Iffo1Q8BXL9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Iffo1Q8BXL9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Iffo1Q8BXL9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Iffo1Q8BXL9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms