Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo38Q8BMI0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo38Q8BMI0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo38Q8BMI0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo38Q8BMI0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo38Q8BMI0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo38Q8BMI0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo38Q8BMI0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo38Q8BMI0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo38Q8BMI0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo38Q8BMI0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo38Q8BMI0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo38Q8BMI0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo38Q8BMI0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo38Q8BMI0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo38Q8BMI0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo38Q8BMI0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo38Q8BMI0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo38Q8BMI0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo38Q8BMI0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo38Q8BMI0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxo38Q8BMI0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxo38Q8BMI0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxo38Q8BMI0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxo38Q8BMI0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxo38Q8BMI0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbxo38Q8BMI0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbxo38Q8BMI0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbxo38Q8BMI0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbxo38Q8BMI0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbxo38Q8BMI0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbxo38Q8BMI0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo38Q8BMI0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo38Q8BMI0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo38Q8BMI0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo38Q8BMI0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo38Q8BMI0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo38Q8BMI0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo38Q8BMI0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxo38Q8BMI0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxo38Q8BMI0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxo38Q8BMI0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxo38Q8BMI0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxo38Q8BMI0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo38Q8BMI0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo38Q8BMI0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo38Q8BMI0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo38Q8BMI0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo38Q8BMI0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo38Q8BMI0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo38Q8BMI0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo38Q8BMI0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo38Q8BMI0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo38Q8BMI0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo38Q8BMI0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo38Q8BMI0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo38Q8BMI0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo38Q8BMI0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo38Q8BMI0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo38Q8BMI0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo38Q8BMI0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fbxo38Q8BMI0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxo38Q8BMI0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxo38Q8BMI0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxo38Q8BMI0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxo38Q8BMI0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxo38Q8BMI0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxo38Q8BMI0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxo38Q8BMI0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxo38Q8BMI0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxo38Q8BMI0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxo38Q8BMI0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxo38Q8BMI0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo38Q8BMI0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo38Q8BMI0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo38Q8BMI0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo38Q8BMI0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo38Q8BMI0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo38Q8BMI0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo38Q8BMI0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo38Q8BMI0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo38Q8BMI0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo38Q8BMI0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo38Q8BMI0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo38Q8BMI0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo38Q8BMI0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fbxo38Q8BMI0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fbxo38Q8BMI0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fbxo38Q8BMI0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fbxo38Q8BMI0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo38Q8BMI0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo38Q8BMI0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo38Q8BMI0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo38Q8BMI0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo38Q8BMI0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo38Q8BMI0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo38Q8BMI0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo38Q8BMI0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo38Q8BMI0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo38Q8BMI0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms