Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGZ3

Dcaf12, DDB1- and CUL4-associated factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcaf12Q8BGZ3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dcaf12Q8BGZ3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dcaf12Q8BGZ3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dcaf12Q8BGZ3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dcaf12Q8BGZ3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dcaf12Q8BGZ3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dcaf12Q8BGZ3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dcaf12Q8BGZ3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dcaf12Q8BGZ3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dcaf12Q8BGZ3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dcaf12Q8BGZ3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dcaf12Q8BGZ3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dcaf12Q8BGZ3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dcaf12Q8BGZ3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dcaf12Q8BGZ3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dcaf12Q8BGZ3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Dcaf12Q8BGZ3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dcaf12Q8BGZ3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dcaf12Q8BGZ3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dcaf12Q8BGZ3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dcaf12Q8BGZ3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dcaf12Q8BGZ3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Dcaf12Q8BGZ3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dcaf12Q8BGZ3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dcaf12Q8BGZ3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dcaf12Q8BGZ3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Dcaf12Q8BGZ3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dcaf12Q8BGZ3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dcaf12Q8BGZ3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Dcaf12Q8BGZ3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dcaf12Q8BGZ3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dcaf12Q8BGZ3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dcaf12Q8BGZ3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dcaf12Q8BGZ3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dcaf12Q8BGZ3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dcaf12Q8BGZ3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dcaf12Q8BGZ3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Dcaf12Q8BGZ3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dcaf12Q8BGZ3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dcaf12Q8BGZ3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dcaf12Q8BGZ3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Dcaf12Q8BGZ3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dcaf12Q8BGZ3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dcaf12Q8BGZ3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dcaf12Q8BGZ3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dcaf12Q8BGZ3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Dcaf12Q8BGZ3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dcaf12Q8BGZ3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dcaf12Q8BGZ3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dcaf12Q8BGZ3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Dcaf12Q8BGZ3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dcaf12Q8BGZ3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dcaf12Q8BGZ3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dcaf12Q8BGZ3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176.4 ms