Protein–RNA interactions for Protein: Q80WJ6

Abcc12, Multidrug resistance-associated protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc12Q80WJ6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Abcc12Q80WJ6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Abcc12Q80WJ6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Abcc12Q80WJ6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Abcc12Q80WJ6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Abcc12Q80WJ6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Abcc12Q80WJ6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Abcc12Q80WJ6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Abcc12Q80WJ6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Abcc12Q80WJ6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Abcc12Q80WJ6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Abcc12Q80WJ6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Abcc12Q80WJ6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Abcc12Q80WJ6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Abcc12Q80WJ6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Abcc12Q80WJ6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Abcc12Q80WJ6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Abcc12Q80WJ6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Abcc12Q80WJ6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Abcc12Q80WJ6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Abcc12Q80WJ6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Abcc12Q80WJ6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Abcc12Q80WJ6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Abcc12Q80WJ6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Abcc12Q80WJ6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Abcc12Q80WJ6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Abcc12Q80WJ6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Abcc12Q80WJ6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Abcc12Q80WJ6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Abcc12Q80WJ6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Abcc12Q80WJ6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Abcc12Q80WJ6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Abcc12Q80WJ6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcc12Q80WJ6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcc12Q80WJ6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcc12Q80WJ6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc12Q80WJ6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc12Q80WJ6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Abcc12Q80WJ6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Abcc12Q80WJ6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc12Q80WJ6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc12Q80WJ6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc12Q80WJ6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc12Q80WJ6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc12Q80WJ6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc12Q80WJ6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc12Q80WJ6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc12Q80WJ6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc12Q80WJ6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc12Q80WJ6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc12Q80WJ6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc12Q80WJ6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc12Q80WJ6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc12Q80WJ6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc12Q80WJ6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Abcc12Q80WJ6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Abcc12Q80WJ6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc12Q80WJ6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc12Q80WJ6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc12Q80WJ6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc12Q80WJ6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc12Q80WJ6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc12Q80WJ6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Abcc12Q80WJ6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Abcc12Q80WJ6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Abcc12Q80WJ6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Abcc12Q80WJ6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Abcc12Q80WJ6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Abcc12Q80WJ6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Abcc12Q80WJ6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc12Q80WJ6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc12Q80WJ6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc12Q80WJ6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc12Q80WJ6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc12Q80WJ6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc12Q80WJ6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc12Q80WJ6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc12Q80WJ6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc12Q80WJ6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc12Q80WJ6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc12Q80WJ6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Abcc12Q80WJ6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Abcc12Q80WJ6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Abcc12Q80WJ6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Abcc12Q80WJ6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Abcc12Q80WJ6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Abcc12Q80WJ6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Abcc12Q80WJ6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Abcc12Q80WJ6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Abcc12Q80WJ6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Abcc12Q80WJ6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Abcc12Q80WJ6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Abcc12Q80WJ6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Abcc12Q80WJ6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Abcc12Q80WJ6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Abcc12Q80WJ6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Abcc12Q80WJ6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Abcc12Q80WJ6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Abcc12Q80WJ6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Abcc12Q80WJ6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms