Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ube2q1Q7TSS2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ube2q1Q7TSS2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube2q1Q7TSS2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube2q1Q7TSS2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube2q1Q7TSS2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ube2q1Q7TSS2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ube2q1Q7TSS2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ube2q1Q7TSS2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ube2q1Q7TSS2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube2q1Q7TSS2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube2q1Q7TSS2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube2q1Q7TSS2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube2q1Q7TSS2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube2q1Q7TSS2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube2q1Q7TSS2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube2q1Q7TSS2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ube2q1Q7TSS2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ube2q1Q7TSS2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ube2q1Q7TSS2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ube2q1Q7TSS2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube2q1Q7TSS2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube2q1Q7TSS2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube2q1Q7TSS2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube2q1Q7TSS2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube2q1Q7TSS2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube2q1Q7TSS2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ube2q1Q7TSS2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ube2q1Q7TSS2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ube2q1Q7TSS2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ube2q1Q7TSS2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ube2q1Q7TSS2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ube2q1Q7TSS2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ube2q1Q7TSS2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ube2q1Q7TSS2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ube2q1Q7TSS2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ube2q1Q7TSS2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ube2q1Q7TSS2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ube2q1Q7TSS2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ube2q1Q7TSS2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ube2q1Q7TSS2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ube2q1Q7TSS2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube2q1Q7TSS2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube2q1Q7TSS2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube2q1Q7TSS2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube2q1Q7TSS2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ube2q1Q7TSS2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ube2q1Q7TSS2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ube2q1Q7TSS2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ube2q1Q7TSS2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ube2q1Q7TSS2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ube2q1Q7TSS2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ube2q1Q7TSS2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ube2q1Q7TSS2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ube2q1Q7TSS2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ube2q1Q7TSS2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ube2q1Q7TSS2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ube2q1Q7TSS2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ube2q1Q7TSS2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms