Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNG8

Ldhd, Probable D-lactate dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LdhdQ7TNG8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LdhdQ7TNG8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LdhdQ7TNG8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LdhdQ7TNG8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LdhdQ7TNG8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LdhdQ7TNG8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LdhdQ7TNG8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LdhdQ7TNG8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LdhdQ7TNG8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LdhdQ7TNG8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LdhdQ7TNG8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LdhdQ7TNG8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LdhdQ7TNG8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LdhdQ7TNG8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LdhdQ7TNG8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LdhdQ7TNG8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LdhdQ7TNG8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LdhdQ7TNG8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LdhdQ7TNG8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LdhdQ7TNG8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LdhdQ7TNG8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LdhdQ7TNG8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LdhdQ7TNG8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LdhdQ7TNG8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LdhdQ7TNG8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LdhdQ7TNG8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LdhdQ7TNG8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LdhdQ7TNG8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LdhdQ7TNG8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LdhdQ7TNG8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LdhdQ7TNG8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LdhdQ7TNG8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LdhdQ7TNG8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LdhdQ7TNG8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LdhdQ7TNG8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LdhdQ7TNG8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LdhdQ7TNG8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LdhdQ7TNG8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LdhdQ7TNG8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LdhdQ7TNG8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LdhdQ7TNG8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LdhdQ7TNG8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LdhdQ7TNG8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LdhdQ7TNG8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LdhdQ7TNG8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LdhdQ7TNG8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LdhdQ7TNG8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LdhdQ7TNG8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LdhdQ7TNG8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LdhdQ7TNG8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LdhdQ7TNG8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LdhdQ7TNG8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LdhdQ7TNG8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LdhdQ7TNG8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LdhdQ7TNG8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LdhdQ7TNG8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LdhdQ7TNG8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LdhdQ7TNG8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LdhdQ7TNG8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LdhdQ7TNG8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LdhdQ7TNG8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LdhdQ7TNG8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LdhdQ7TNG8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LdhdQ7TNG8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LdhdQ7TNG8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LdhdQ7TNG8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LdhdQ7TNG8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LdhdQ7TNG8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LdhdQ7TNG8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LdhdQ7TNG8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LdhdQ7TNG8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LdhdQ7TNG8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LdhdQ7TNG8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LdhdQ7TNG8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LdhdQ7TNG8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LdhdQ7TNG8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LdhdQ7TNG8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LdhdQ7TNG8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LdhdQ7TNG8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LdhdQ7TNG8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LdhdQ7TNG8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LdhdQ7TNG8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LdhdQ7TNG8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LdhdQ7TNG8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LdhdQ7TNG8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LdhdQ7TNG8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LdhdQ7TNG8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LdhdQ7TNG8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LdhdQ7TNG8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LdhdQ7TNG8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LdhdQ7TNG8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LdhdQ7TNG8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LdhdQ7TNG8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LdhdQ7TNG8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LdhdQ7TNG8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LdhdQ7TNG8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LdhdQ7TNG8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
LdhdQ7TNG8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LdhdQ7TNG8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LdhdQ7TNG8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms