Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf139Q7TMV1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rnf139Q7TMV1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf139Q7TMV1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms