Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sned1Q70E20 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sned1Q70E20 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sned1Q70E20 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sned1Q70E20 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sned1Q70E20 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sned1Q70E20 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sned1Q70E20 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sned1Q70E20 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sned1Q70E20 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sned1Q70E20 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sned1Q70E20 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sned1Q70E20 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Sned1Q70E20 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sned1Q70E20 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Sned1Q70E20 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sned1Q70E20 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sned1Q70E20 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sned1Q70E20 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Sned1Q70E20 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sned1Q70E20 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sned1Q70E20 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sned1Q70E20 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sned1Q70E20 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sned1Q70E20 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sned1Q70E20 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sned1Q70E20 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sned1Q70E20 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sned1Q70E20 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sned1Q70E20 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sned1Q70E20 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sned1Q70E20 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sned1Q70E20 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Sned1Q70E20 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sned1Q70E20 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sned1Q70E20 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sned1Q70E20 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sned1Q70E20 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sned1Q70E20 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sned1Q70E20 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sned1Q70E20 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sned1Q70E20 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sned1Q70E20 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Sned1Q70E20 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sned1Q70E20 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Sned1Q70E20 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sned1Q70E20 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sned1Q70E20 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sned1Q70E20 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sned1Q70E20 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sned1Q70E20 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Sned1Q70E20 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sned1Q70E20 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sned1Q70E20 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sned1Q70E20 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sned1Q70E20 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sned1Q70E20 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sned1Q70E20 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sned1Q70E20 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sned1Q70E20 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sned1Q70E20 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sned1Q70E20 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sned1Q70E20 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sned1Q70E20 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sned1Q70E20 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sned1Q70E20 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sned1Q70E20 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Sned1Q70E20 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sned1Q70E20 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sned1Q70E20 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sned1Q70E20 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sned1Q70E20 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sned1Q70E20 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sned1Q70E20 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sned1Q70E20 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sned1Q70E20 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sned1Q70E20 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sned1Q70E20 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Sned1Q70E20 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sned1Q70E20 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sned1Q70E20 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sned1Q70E20 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sned1Q70E20 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sned1Q70E20 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sned1Q70E20 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sned1Q70E20 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sned1Q70E20 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sned1Q70E20 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sned1Q70E20 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sned1Q70E20 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sned1Q70E20 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Sned1Q70E20 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sned1Q70E20 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sned1Q70E20 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sned1Q70E20 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sned1Q70E20 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sned1Q70E20 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sned1Q70E20 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sned1Q70E20 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sned1Q70E20 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms