Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPJ3

Ube2o, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme UBE2O, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2oQ6ZPJ3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ube2oQ6ZPJ3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ube2oQ6ZPJ3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ube2oQ6ZPJ3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ube2oQ6ZPJ3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ube2oQ6ZPJ3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ube2oQ6ZPJ3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ube2oQ6ZPJ3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ube2oQ6ZPJ3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ube2oQ6ZPJ3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ube2oQ6ZPJ3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ube2oQ6ZPJ3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ube2oQ6ZPJ3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ube2oQ6ZPJ3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ube2oQ6ZPJ3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ube2oQ6ZPJ3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ube2oQ6ZPJ3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ube2oQ6ZPJ3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ube2oQ6ZPJ3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ube2oQ6ZPJ3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ube2oQ6ZPJ3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ube2oQ6ZPJ3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ube2oQ6ZPJ3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ube2oQ6ZPJ3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ube2oQ6ZPJ3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ube2oQ6ZPJ3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ube2oQ6ZPJ3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ube2oQ6ZPJ3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ube2oQ6ZPJ3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ube2oQ6ZPJ3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ube2oQ6ZPJ3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ube2oQ6ZPJ3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ube2oQ6ZPJ3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ube2oQ6ZPJ3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ube2oQ6ZPJ3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ube2oQ6ZPJ3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ube2oQ6ZPJ3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ube2oQ6ZPJ3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ube2oQ6ZPJ3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ube2oQ6ZPJ3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ube2oQ6ZPJ3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ube2oQ6ZPJ3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ube2oQ6ZPJ3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ube2oQ6ZPJ3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ube2oQ6ZPJ3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ube2oQ6ZPJ3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ube2oQ6ZPJ3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ube2oQ6ZPJ3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ube2oQ6ZPJ3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ube2oQ6ZPJ3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ube2oQ6ZPJ3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ube2oQ6ZPJ3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ube2oQ6ZPJ3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ube2oQ6ZPJ3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms