Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Timd4Q6U7R4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Timd4Q6U7R4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Timd4Q6U7R4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Timd4Q6U7R4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Timd4Q6U7R4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Timd4Q6U7R4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Timd4Q6U7R4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Timd4Q6U7R4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Timd4Q6U7R4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Timd4Q6U7R4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Timd4Q6U7R4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Timd4Q6U7R4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Timd4Q6U7R4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Timd4Q6U7R4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Timd4Q6U7R4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Timd4Q6U7R4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms