Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIX5

Rhbdf1, Inactive rhomboid protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdf1Q6PIX5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rhbdf1Q6PIX5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rhbdf1Q6PIX5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rhbdf1Q6PIX5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rhbdf1Q6PIX5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rhbdf1Q6PIX5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rhbdf1Q6PIX5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rhbdf1Q6PIX5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rhbdf1Q6PIX5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rhbdf1Q6PIX5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rhbdf1Q6PIX5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rhbdf1Q6PIX5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhbdf1Q6PIX5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhbdf1Q6PIX5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhbdf1Q6PIX5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhbdf1Q6PIX5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhbdf1Q6PIX5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhbdf1Q6PIX5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhbdf1Q6PIX5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhbdf1Q6PIX5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rhbdf1Q6PIX5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rhbdf1Q6PIX5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rhbdf1Q6PIX5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rhbdf1Q6PIX5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rhbdf1Q6PIX5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rhbdf1Q6PIX5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rhbdf1Q6PIX5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rhbdf1Q6PIX5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rhbdf1Q6PIX5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rhbdf1Q6PIX5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rhbdf1Q6PIX5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rhbdf1Q6PIX5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rhbdf1Q6PIX5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rhbdf1Q6PIX5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rhbdf1Q6PIX5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rhbdf1Q6PIX5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Rhbdf1Q6PIX5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhbdf1Q6PIX5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhbdf1Q6PIX5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhbdf1Q6PIX5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhbdf1Q6PIX5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhbdf1Q6PIX5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhbdf1Q6PIX5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhbdf1Q6PIX5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhbdf1Q6PIX5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rhbdf1Q6PIX5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rhbdf1Q6PIX5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rhbdf1Q6PIX5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rhbdf1Q6PIX5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rhbdf1Q6PIX5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.8 ms