Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Med16Q6PGF3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Med16Q6PGF3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Med16Q6PGF3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Med16Q6PGF3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Med16Q6PGF3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Med16Q6PGF3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Med16Q6PGF3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Med16Q6PGF3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Med16Q6PGF3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Med16Q6PGF3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Med16Q6PGF3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Med16Q6PGF3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Med16Q6PGF3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Med16Q6PGF3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Med16Q6PGF3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Med16Q6PGF3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Med16Q6PGF3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Med16Q6PGF3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Med16Q6PGF3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Med16Q6PGF3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Med16Q6PGF3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Med16Q6PGF3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Med16Q6PGF3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Med16Q6PGF3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Med16Q6PGF3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Med16Q6PGF3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Med16Q6PGF3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Med16Q6PGF3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Med16Q6PGF3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Med16Q6PGF3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Med16Q6PGF3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Med16Q6PGF3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Med16Q6PGF3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Med16Q6PGF3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Med16Q6PGF3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms