Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGC9

Zfp341, Zinc finger protein 341, mousemouse

Predictions only

Length 846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp341Q6PGC9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zfp341Q6PGC9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zfp341Q6PGC9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Zfp341Q6PGC9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Zfp341Q6PGC9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zfp341Q6PGC9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zfp341Q6PGC9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Zfp341Q6PGC9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zfp341Q6PGC9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zfp341Q6PGC9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zfp341Q6PGC9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zfp341Q6PGC9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zfp341Q6PGC9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zfp341Q6PGC9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Zfp341Q6PGC9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zfp341Q6PGC9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zfp341Q6PGC9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zfp341Q6PGC9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zfp341Q6PGC9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zfp341Q6PGC9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zfp341Q6PGC9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zfp341Q6PGC9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zfp341Q6PGC9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zfp341Q6PGC9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zfp341Q6PGC9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp341Q6PGC9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp341Q6PGC9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp341Q6PGC9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp341Q6PGC9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp341Q6PGC9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp341Q6PGC9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zfp341Q6PGC9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Zfp341Q6PGC9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zfp341Q6PGC9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zfp341Q6PGC9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zfp341Q6PGC9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zfp341Q6PGC9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfp341Q6PGC9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfp341Q6PGC9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfp341Q6PGC9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfp341Q6PGC9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfp341Q6PGC9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfp341Q6PGC9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfp341Q6PGC9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfp341Q6PGC9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfp341Q6PGC9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Zfp341Q6PGC9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zfp341Q6PGC9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zfp341Q6PGC9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zfp341Q6PGC9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zfp341Q6PGC9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zfp341Q6PGC9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zfp341Q6PGC9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zfp341Q6PGC9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zfp341Q6PGC9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zfp341Q6PGC9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zfp341Q6PGC9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zfp341Q6PGC9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zfp341Q6PGC9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zfp341Q6PGC9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Zfp341Q6PGC9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zfp341Q6PGC9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zfp341Q6PGC9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfp341Q6PGC9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfp341Q6PGC9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfp341Q6PGC9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfp341Q6PGC9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zfp341Q6PGC9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zfp341Q6PGC9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Zfp341Q6PGC9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zfp341Q6PGC9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zfp341Q6PGC9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zfp341Q6PGC9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zfp341Q6PGC9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zfp341Q6PGC9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zfp341Q6PGC9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zfp341Q6PGC9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zfp341Q6PGC9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zfp341Q6PGC9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zfp341Q6PGC9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Zfp341Q6PGC9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Zfp341Q6PGC9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Zfp341Q6PGC9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Zfp341Q6PGC9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Zfp341Q6PGC9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zfp341Q6PGC9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zfp341Q6PGC9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zfp341Q6PGC9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zfp341Q6PGC9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zfp341Q6PGC9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zfp341Q6PGC9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zfp341Q6PGC9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zfp341Q6PGC9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zfp341Q6PGC9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Zfp341Q6PGC9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zfp341Q6PGC9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zfp341Q6PGC9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zfp341Q6PGC9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zfp341Q6PGC9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zfp341Q6PGC9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 653.9 ms