Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtifQ6PEE2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtifQ6PEE2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CtifQ6PEE2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CtifQ6PEE2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CtifQ6PEE2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CtifQ6PEE2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CtifQ6PEE2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CtifQ6PEE2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CtifQ6PEE2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CtifQ6PEE2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CtifQ6PEE2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtifQ6PEE2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtifQ6PEE2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtifQ6PEE2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtifQ6PEE2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtifQ6PEE2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtifQ6PEE2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtifQ6PEE2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtifQ6PEE2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtifQ6PEE2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtifQ6PEE2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtifQ6PEE2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtifQ6PEE2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtifQ6PEE2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtifQ6PEE2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtifQ6PEE2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtifQ6PEE2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtifQ6PEE2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtifQ6PEE2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CtifQ6PEE2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtifQ6PEE2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CtifQ6PEE2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtifQ6PEE2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtifQ6PEE2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CtifQ6PEE2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CtifQ6PEE2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CtifQ6PEE2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtifQ6PEE2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CtifQ6PEE2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtifQ6PEE2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtifQ6PEE2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtifQ6PEE2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtifQ6PEE2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtifQ6PEE2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CtifQ6PEE2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtifQ6PEE2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtifQ6PEE2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtifQ6PEE2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtifQ6PEE2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtifQ6PEE2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtifQ6PEE2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtifQ6PEE2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtifQ6PEE2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtifQ6PEE2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtifQ6PEE2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtifQ6PEE2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtifQ6PEE2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtifQ6PEE2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtifQ6PEE2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtifQ6PEE2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtifQ6PEE2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtifQ6PEE2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtifQ6PEE2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtifQ6PEE2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtifQ6PEE2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtifQ6PEE2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtifQ6PEE2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
CtifQ6PEE2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtifQ6PEE2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtifQ6PEE2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtifQ6PEE2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CtifQ6PEE2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CtifQ6PEE2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CtifQ6PEE2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CtifQ6PEE2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CtifQ6PEE2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CtifQ6PEE2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtifQ6PEE2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtifQ6PEE2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtifQ6PEE2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CtifQ6PEE2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CtifQ6PEE2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CtifQ6PEE2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtifQ6PEE2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CtifQ6PEE2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtifQ6PEE2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtifQ6PEE2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtifQ6PEE2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtifQ6PEE2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtifQ6PEE2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtifQ6PEE2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtifQ6PEE2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtifQ6PEE2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtifQ6PEE2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtifQ6PEE2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtifQ6PEE2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CtifQ6PEE2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
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