Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Trak1Q6PD31 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Trak1Q6PD31 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Trak1Q6PD31 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Trak1Q6PD31 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Trak1Q6PD31 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Trak1Q6PD31 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Trak1Q6PD31 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Trak1Q6PD31 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Trak1Q6PD31 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Trak1Q6PD31 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Trak1Q6PD31 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Trak1Q6PD31 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Trak1Q6PD31 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Trak1Q6PD31 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Trak1Q6PD31 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Trak1Q6PD31 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Trak1Q6PD31 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Trak1Q6PD31 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Trak1Q6PD31 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Trak1Q6PD31 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Trak1Q6PD31 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Trak1Q6PD31 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Trak1Q6PD31 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Trak1Q6PD31 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Trak1Q6PD31 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Trak1Q6PD31 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Trak1Q6PD31 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Trak1Q6PD31 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Trak1Q6PD31 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Trak1Q6PD31 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Trak1Q6PD31 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Trak1Q6PD31 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Trak1Q6PD31 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Trak1Q6PD31 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Trak1Q6PD31 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Trak1Q6PD31 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Trak1Q6PD31 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Trak1Q6PD31 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Trak1Q6PD31 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Trak1Q6PD31 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Trak1Q6PD31 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Trak1Q6PD31 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Trak1Q6PD31 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Trak1Q6PD31 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Trak1Q6PD31 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Trak1Q6PD31 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Trak1Q6PD31 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Trak1Q6PD31 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Trak1Q6PD31 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Trak1Q6PD31 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Trak1Q6PD31 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Trak1Q6PD31 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Trak1Q6PD31 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Trak1Q6PD31 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Trak1Q6PD31 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Trak1Q6PD31 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Trak1Q6PD31 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Trak1Q6PD31 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Trak1Q6PD31 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Trak1Q6PD31 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Trak1Q6PD31 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Trak1Q6PD31 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Trak1Q6PD31 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Trak1Q6PD31 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Trak1Q6PD31 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Trak1Q6PD31 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Trak1Q6PD31 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Trak1Q6PD31 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Trak1Q6PD31 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Trak1Q6PD31 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Trak1Q6PD31 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Trak1Q6PD31 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Trak1Q6PD31 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Trak1Q6PD31 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Trak1Q6PD31 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Trak1Q6PD31 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Trak1Q6PD31 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Trak1Q6PD31 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Trak1Q6PD31 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Trak1Q6PD31 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Trak1Q6PD31 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Trak1Q6PD31 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Trak1Q6PD31 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Trak1Q6PD31 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Trak1Q6PD31 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Trak1Q6PD31 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Trak1Q6PD31 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Trak1Q6PD31 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Trak1Q6PD31 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Trak1Q6PD31 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Trak1Q6PD31 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Trak1Q6PD31 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Trak1Q6PD31 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Trak1Q6PD31 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Trak1Q6PD31 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Trak1Q6PD31 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Trak1Q6PD31 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Trak1Q6PD31 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Trak1Q6PD31 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms