Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCY5

Gm2163, 4933409K07Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2163Q6PCY5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm2163Q6PCY5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm2163Q6PCY5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm2163Q6PCY5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm2163Q6PCY5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm2163Q6PCY5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm2163Q6PCY5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm2163Q6PCY5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm2163Q6PCY5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm2163Q6PCY5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm2163Q6PCY5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm2163Q6PCY5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm2163Q6PCY5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm2163Q6PCY5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm2163Q6PCY5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm2163Q6PCY5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm2163Q6PCY5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm2163Q6PCY5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm2163Q6PCY5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm2163Q6PCY5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm2163Q6PCY5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm2163Q6PCY5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm2163Q6PCY5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm2163Q6PCY5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm2163Q6PCY5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm2163Q6PCY5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm2163Q6PCY5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm2163Q6PCY5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm2163Q6PCY5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm2163Q6PCY5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm2163Q6PCY5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm2163Q6PCY5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm2163Q6PCY5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm2163Q6PCY5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm2163Q6PCY5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm2163Q6PCY5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm2163Q6PCY5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm2163Q6PCY5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm2163Q6PCY5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm2163Q6PCY5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm2163Q6PCY5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm2163Q6PCY5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm2163Q6PCY5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm2163Q6PCY5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm2163Q6PCY5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm2163Q6PCY5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm2163Q6PCY5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gm2163Q6PCY5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm2163Q6PCY5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm2163Q6PCY5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm2163Q6PCY5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm2163Q6PCY5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm2163Q6PCY5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm2163Q6PCY5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm2163Q6PCY5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm2163Q6PCY5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm2163Q6PCY5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm2163Q6PCY5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm2163Q6PCY5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm2163Q6PCY5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm2163Q6PCY5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm2163Q6PCY5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm2163Q6PCY5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm2163Q6PCY5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm2163Q6PCY5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm2163Q6PCY5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm2163Q6PCY5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm2163Q6PCY5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm2163Q6PCY5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm2163Q6PCY5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm2163Q6PCY5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm2163Q6PCY5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm2163Q6PCY5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm2163Q6PCY5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm2163Q6PCY5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm2163Q6PCY5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gm2163Q6PCY5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm2163Q6PCY5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm2163Q6PCY5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm2163Q6PCY5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm2163Q6PCY5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm2163Q6PCY5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm2163Q6PCY5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm2163Q6PCY5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm2163Q6PCY5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm2163Q6PCY5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm2163Q6PCY5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm2163Q6PCY5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm2163Q6PCY5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm2163Q6PCY5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm2163Q6PCY5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm2163Q6PCY5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm2163Q6PCY5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm2163Q6PCY5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm2163Q6PCY5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm2163Q6PCY5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm2163Q6PCY5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm2163Q6PCY5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm2163Q6PCY5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm2163Q6PCY5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms