Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB51

Ccdc117, Coiled-coil domain-containing protein 117, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc117Q6PB51 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc117Q6PB51 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc117Q6PB51 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc117Q6PB51 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc117Q6PB51 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc117Q6PB51 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc117Q6PB51 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc117Q6PB51 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc117Q6PB51 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc117Q6PB51 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc117Q6PB51 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc117Q6PB51 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc117Q6PB51 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc117Q6PB51 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc117Q6PB51 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc117Q6PB51 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc117Q6PB51 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc117Q6PB51 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc117Q6PB51 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc117Q6PB51 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc117Q6PB51 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc117Q6PB51 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc117Q6PB51 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc117Q6PB51 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc117Q6PB51 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc117Q6PB51 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc117Q6PB51 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc117Q6PB51 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc117Q6PB51 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc117Q6PB51 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc117Q6PB51 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc117Q6PB51 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc117Q6PB51 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc117Q6PB51 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc117Q6PB51 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc117Q6PB51 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc117Q6PB51 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc117Q6PB51 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc117Q6PB51 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc117Q6PB51 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc117Q6PB51 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc117Q6PB51 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc117Q6PB51 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc117Q6PB51 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc117Q6PB51 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc117Q6PB51 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc117Q6PB51 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc117Q6PB51 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc117Q6PB51 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc117Q6PB51 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc117Q6PB51 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc117Q6PB51 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc117Q6PB51 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms