Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K8

Cpa4, Carboxypeptidase A4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa4Q6P8K8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpa4Q6P8K8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpa4Q6P8K8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpa4Q6P8K8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpa4Q6P8K8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpa4Q6P8K8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpa4Q6P8K8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpa4Q6P8K8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpa4Q6P8K8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpa4Q6P8K8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpa4Q6P8K8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpa4Q6P8K8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpa4Q6P8K8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpa4Q6P8K8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpa4Q6P8K8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpa4Q6P8K8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpa4Q6P8K8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpa4Q6P8K8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpa4Q6P8K8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpa4Q6P8K8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpa4Q6P8K8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpa4Q6P8K8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpa4Q6P8K8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpa4Q6P8K8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpa4Q6P8K8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpa4Q6P8K8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpa4Q6P8K8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpa4Q6P8K8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpa4Q6P8K8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpa4Q6P8K8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpa4Q6P8K8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpa4Q6P8K8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpa4Q6P8K8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpa4Q6P8K8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpa4Q6P8K8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpa4Q6P8K8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpa4Q6P8K8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpa4Q6P8K8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpa4Q6P8K8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpa4Q6P8K8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpa4Q6P8K8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpa4Q6P8K8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpa4Q6P8K8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpa4Q6P8K8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpa4Q6P8K8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpa4Q6P8K8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpa4Q6P8K8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpa4Q6P8K8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpa4Q6P8K8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpa4Q6P8K8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpa4Q6P8K8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpa4Q6P8K8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpa4Q6P8K8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpa4Q6P8K8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpa4Q6P8K8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpa4Q6P8K8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpa4Q6P8K8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpa4Q6P8K8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpa4Q6P8K8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpa4Q6P8K8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpa4Q6P8K8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cpa4Q6P8K8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cpa4Q6P8K8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cpa4Q6P8K8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cpa4Q6P8K8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms