Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atg2aQ6P4T0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg2aQ6P4T0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg2aQ6P4T0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg2aQ6P4T0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg2aQ6P4T0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg2aQ6P4T0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg2aQ6P4T0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg2aQ6P4T0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg2aQ6P4T0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg2aQ6P4T0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg2aQ6P4T0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg2aQ6P4T0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg2aQ6P4T0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg2aQ6P4T0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg2aQ6P4T0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg2aQ6P4T0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg2aQ6P4T0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg2aQ6P4T0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg2aQ6P4T0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg2aQ6P4T0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg2aQ6P4T0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg2aQ6P4T0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg2aQ6P4T0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg2aQ6P4T0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg2aQ6P4T0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg2aQ6P4T0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg2aQ6P4T0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg2aQ6P4T0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg2aQ6P4T0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg2aQ6P4T0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg2aQ6P4T0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg2aQ6P4T0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg2aQ6P4T0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg2aQ6P4T0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg2aQ6P4T0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg2aQ6P4T0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg2aQ6P4T0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg2aQ6P4T0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg2aQ6P4T0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg2aQ6P4T0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg2aQ6P4T0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg2aQ6P4T0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg2aQ6P4T0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg2aQ6P4T0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg2aQ6P4T0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg2aQ6P4T0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg2aQ6P4T0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg2aQ6P4T0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg2aQ6P4T0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg2aQ6P4T0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg2aQ6P4T0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg2aQ6P4T0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg2aQ6P4T0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg2aQ6P4T0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg2aQ6P4T0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg2aQ6P4T0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg2aQ6P4T0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg2aQ6P4T0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg2aQ6P4T0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg2aQ6P4T0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg2aQ6P4T0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg2aQ6P4T0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg2aQ6P4T0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg2aQ6P4T0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg2aQ6P4T0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg2aQ6P4T0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg2aQ6P4T0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg2aQ6P4T0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg2aQ6P4T0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg2aQ6P4T0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg2aQ6P4T0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg2aQ6P4T0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg2aQ6P4T0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg2aQ6P4T0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg2aQ6P4T0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg2aQ6P4T0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg2aQ6P4T0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg2aQ6P4T0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg2aQ6P4T0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg2aQ6P4T0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg2aQ6P4T0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg2aQ6P4T0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg2aQ6P4T0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg2aQ6P4T0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg2aQ6P4T0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg2aQ6P4T0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg2aQ6P4T0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg2aQ6P4T0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg2aQ6P4T0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg2aQ6P4T0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg2aQ6P4T0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg2aQ6P4T0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg2aQ6P4T0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg2aQ6P4T0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg2aQ6P4T0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg2aQ6P4T0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg2aQ6P4T0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg2aQ6P4T0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg2aQ6P4T0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms