Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac10Q6P3E7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac10Q6P3E7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac10Q6P3E7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac10Q6P3E7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac10Q6P3E7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac10Q6P3E7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac10Q6P3E7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac10Q6P3E7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac10Q6P3E7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac10Q6P3E7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac10Q6P3E7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac10Q6P3E7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms