Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac4Q6NZM9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac4Q6NZM9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac4Q6NZM9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac4Q6NZM9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac4Q6NZM9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac4Q6NZM9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac4Q6NZM9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac4Q6NZM9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac4Q6NZM9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac4Q6NZM9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac4Q6NZM9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac4Q6NZM9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac4Q6NZM9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac4Q6NZM9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac4Q6NZM9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac4Q6NZM9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac4Q6NZM9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac4Q6NZM9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac4Q6NZM9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac4Q6NZM9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac4Q6NZM9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac4Q6NZM9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac4Q6NZM9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac4Q6NZM9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac4Q6NZM9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac4Q6NZM9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac4Q6NZM9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac4Q6NZM9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac4Q6NZM9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac4Q6NZM9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac4Q6NZM9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hdac4Q6NZM9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hdac4Q6NZM9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdac4Q6NZM9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdac4Q6NZM9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdac4Q6NZM9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdac4Q6NZM9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdac4Q6NZM9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac4Q6NZM9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac4Q6NZM9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac4Q6NZM9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac4Q6NZM9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac4Q6NZM9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac4Q6NZM9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac4Q6NZM9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac4Q6NZM9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac4Q6NZM9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac4Q6NZM9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac4Q6NZM9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac4Q6NZM9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac4Q6NZM9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac4Q6NZM9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac4Q6NZM9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac4Q6NZM9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac4Q6NZM9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac4Q6NZM9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac4Q6NZM9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac4Q6NZM9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac4Q6NZM9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac4Q6NZM9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac4Q6NZM9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac4Q6NZM9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac4Q6NZM9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac4Q6NZM9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac4Q6NZM9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms