Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ParpbpQ6IRT3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ParpbpQ6IRT3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms