Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Msl2Q69ZF8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msl2Q69ZF8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms