Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PatjQ63ZW7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PatjQ63ZW7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PatjQ63ZW7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PatjQ63ZW7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PatjQ63ZW7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PatjQ63ZW7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PatjQ63ZW7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PatjQ63ZW7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PatjQ63ZW7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PatjQ63ZW7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PatjQ63ZW7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PatjQ63ZW7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PatjQ63ZW7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PatjQ63ZW7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PatjQ63ZW7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PatjQ63ZW7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PatjQ63ZW7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PatjQ63ZW7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PatjQ63ZW7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PatjQ63ZW7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PatjQ63ZW7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PatjQ63ZW7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PatjQ63ZW7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PatjQ63ZW7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PatjQ63ZW7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PatjQ63ZW7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PatjQ63ZW7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PatjQ63ZW7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PatjQ63ZW7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PatjQ63ZW7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PatjQ63ZW7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PatjQ63ZW7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PatjQ63ZW7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PatjQ63ZW7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PatjQ63ZW7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PatjQ63ZW7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PatjQ63ZW7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PatjQ63ZW7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PatjQ63ZW7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PatjQ63ZW7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PatjQ63ZW7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PatjQ63ZW7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PatjQ63ZW7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PatjQ63ZW7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PatjQ63ZW7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PatjQ63ZW7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PatjQ63ZW7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PatjQ63ZW7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PatjQ63ZW7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PatjQ63ZW7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PatjQ63ZW7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PatjQ63ZW7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PatjQ63ZW7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PatjQ63ZW7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PatjQ63ZW7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PatjQ63ZW7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PatjQ63ZW7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PatjQ63ZW7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PatjQ63ZW7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PatjQ63ZW7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PatjQ63ZW7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 267.5 ms