Protein–RNA interactions for Protein: Q63994

Cd33, Myeloid cell surface antigen CD33, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd33Q63994 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd33Q63994 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms