Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssr4Q62186 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssr4Q62186 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssr4Q62186 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssr4Q62186 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssr4Q62186 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssr4Q62186 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssr4Q62186 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssr4Q62186 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssr4Q62186 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssr4Q62186 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssr4Q62186 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssr4Q62186 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssr4Q62186 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssr4Q62186 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssr4Q62186 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ssr4Q62186 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ssr4Q62186 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ssr4Q62186 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ssr4Q62186 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ssr4Q62186 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ssr4Q62186 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ssr4Q62186 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssr4Q62186 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssr4Q62186 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssr4Q62186 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssr4Q62186 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssr4Q62186 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ssr4Q62186 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ssr4Q62186 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ssr4Q62186 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ssr4Q62186 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ssr4Q62186 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ssr4Q62186 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ssr4Q62186 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ssr4Q62186 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssr4Q62186 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssr4Q62186 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssr4Q62186 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssr4Q62186 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssr4Q62186 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssr4Q62186 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssr4Q62186 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssr4Q62186 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssr4Q62186 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssr4Q62186 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssr4Q62186 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssr4Q62186 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssr4Q62186 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssr4Q62186 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssr4Q62186 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssr4Q62186 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssr4Q62186 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssr4Q62186 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssr4Q62186 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssr4Q62186 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssr4Q62186 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssr4Q62186 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssr4Q62186 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssr4Q62186 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms