Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aldh1a2Q62148 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aldh1a2Q62148 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aldh1a2Q62148 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aldh1a2Q62148 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Aldh1a2Q62148 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aldh1a2Q62148 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aldh1a2Q62148 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aldh1a2Q62148 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aldh1a2Q62148 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aldh1a2Q62148 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aldh1a2Q62148 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aldh1a2Q62148 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aldh1a2Q62148 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aldh1a2Q62148 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aldh1a2Q62148 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aldh1a2Q62148 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Aldh1a2Q62148 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aldh1a2Q62148 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aldh1a2Q62148 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aldh1a2Q62148 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aldh1a2Q62148 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aldh1a2Q62148 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aldh1a2Q62148 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aldh1a2Q62148 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aldh1a2Q62148 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aldh1a2Q62148 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aldh1a2Q62148 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aldh1a2Q62148 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aldh1a2Q62148 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aldh1a2Q62148 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aldh1a2Q62148 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aldh1a2Q62148 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aldh1a2Q62148 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aldh1a2Q62148 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aldh1a2Q62148 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aldh1a2Q62148 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Aldh1a2Q62148 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aldh1a2Q62148 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aldh1a2Q62148 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aldh1a2Q62148 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aldh1a2Q62148 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aldh1a2Q62148 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aldh1a2Q62148 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh1a2Q62148 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh1a2Q62148 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh1a2Q62148 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh1a2Q62148 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh1a2Q62148 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh1a2Q62148 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh1a2Q62148 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh1a2Q62148 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Aldh1a2Q62148 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Aldh1a2Q62148 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aldh1a2Q62148 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aldh1a2Q62148 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aldh1a2Q62148 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aldh1a2Q62148 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aldh1a2Q62148 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aldh1a2Q62148 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Aldh1a2Q62148 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aldh1a2Q62148 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aldh1a2Q62148 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Aldh1a2Q62148 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aldh1a2Q62148 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aldh1a2Q62148 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aldh1a2Q62148 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aldh1a2Q62148 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aldh1a2Q62148 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aldh1a2Q62148 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Aldh1a2Q62148 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Aldh1a2Q62148 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Aldh1a2Q62148 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Aldh1a2Q62148 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Aldh1a2Q62148 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Aldh1a2Q62148 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Aldh1a2Q62148 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Aldh1a2Q62148 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Aldh1a2Q62148 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Aldh1a2Q62148 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Aldh1a2Q62148 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Aldh1a2Q62148 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Aldh1a2Q62148 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms