Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifi47Q61635 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifi47Q61635 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifi47Q61635 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifi47Q61635 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifi47Q61635 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifi47Q61635 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifi47Q61635 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifi47Q61635 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifi47Q61635 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifi47Q61635 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifi47Q61635 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifi47Q61635 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifi47Q61635 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifi47Q61635 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifi47Q61635 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifi47Q61635 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifi47Q61635 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifi47Q61635 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifi47Q61635 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifi47Q61635 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifi47Q61635 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifi47Q61635 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifi47Q61635 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifi47Q61635 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifi47Q61635 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifi47Q61635 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifi47Q61635 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifi47Q61635 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifi47Q61635 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifi47Q61635 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifi47Q61635 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifi47Q61635 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifi47Q61635 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifi47Q61635 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifi47Q61635 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifi47Q61635 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifi47Q61635 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifi47Q61635 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifi47Q61635 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifi47Q61635 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifi47Q61635 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifi47Q61635 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifi47Q61635 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifi47Q61635 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifi47Q61635 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ifi47Q61635 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ifi47Q61635 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ifi47Q61635 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ifi47Q61635 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ifi47Q61635 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifi47Q61635 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifi47Q61635 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifi47Q61635 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifi47Q61635 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifi47Q61635 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms