Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vsx2Q61412 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vsx2Q61412 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vsx2Q61412 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vsx2Q61412 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vsx2Q61412 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vsx2Q61412 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vsx2Q61412 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vsx2Q61412 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vsx2Q61412 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vsx2Q61412 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vsx2Q61412 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vsx2Q61412 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vsx2Q61412 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms